◆対象

• WordPress Ver 2.7
• Simple Tags Ver 1.6.5
• PHP 4

追記：Simple Tags Ver 1.6.6が出ましたが、
更新内容を見る限りではそのまま使えるかと思います。

◆解決法

/simple-tags/2.7/simple-tags.client.php
の1030行目辺りの

$all_related_tags = array_intersect_key($all_related_tags, array_unique(array_map('serialize', $all_related_tags)));

// Exclude current tags
foreach ( (array) $all_related_tags as $tag ) {
    if ( !in_array($tag->slug, $current_slugs) ) {
        $related_tags[] = $tag;
    }
}

を

foreach($all_related_tags as $tag){
    $only_tag = true;
    foreach($related_tags as $tag_test){
        if($tag_test == $tag){
            $only_tag = false;
            break;
        }
    }
    if($only_tag === true){
        $related_tags[] = $tag;
    }
}

に変える。
元のソースの意味、まだ今一分かってないんですが、、

まあ一応このブログでは動いているんで大丈夫じゃないかと思います、
diff,patchが扱える方はhttp://w3-info.net/files/modification/simple-tags/diff0.patch
をどうぞ

◆おまけ

触ってたら改造したくなったので欲しい機能をいくつか追加してみました。

http://w3-info.net/files/modification/simple-tags/simple-tags.client.php.txt

• タグ一覧が選択タグで絞り込まれるように（これは別のところから持ってきたもの
• 絞り込まれたタグとそれ以外の標準で表示されるタグを別の書式で表示されるように
• %tag_link_add_and% %tag_link_add_or% が使えるように
  （元の%tag_link_add%は廃止）

最初のはSimple Tags プラグインのタグ絞り込みのバグ修正
を参考、もといほぼ丸パクリ状態、

二つ目の"それ以外の標準で表示されるタグ"の書式は
920行目辺りにxformat_diffってのが新しく出来ているんでそこを弄る

patchファイル：http://w3-info.net/files/modification/simple-tags/diff1.patch

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出来れば%tag_count%で表示される数も絞り込んだ数にしたかったんですが、
DB扱う知識が殆どないので断念、
ちなみに*と+は積集合、和集合からだったり（どーでも